Prostatas vēzis: Lielie dati atklāj 80 jaunus narkotiku mērķus
Lielākajā pētījumā, lai analizētu prostatas vēža ģenētiku, zinātnieki atrod ne mazāk kā 80 jaunus potenciālos narkotiku mērķus. Projekts paver plašas iespējas jaunu ārstniecības līdzekļu izstrādei.
Ģenētisko datu iegūšana reiz bija apgrūtinošs un neticami laikietilpīgs uzdevums.
Tomēr, tā kā tehnoloģija turpina uzlaboties, darbs ir kļuvis ievērojami ātrāks un lētāks.
Paralēli ir ievērojami uzlabojušies pieejamie rīki lielu datu kopu apstrādei.
Kopā tas nozīmē, ka no ģenētiskā koda iegūtās informācijas okeānus var analizēt, kartēt un salīdzinoši viegli apvienot, lai nodrošinātu jaunu skaidrības līmeni.
Nesen starptautiska komanda izmantoja šo DNS analīzes un lielo datu divvirzienu pieeju, lai iedziļinātos prostatas vēža ģenētikā. Meklējot molekulāros činkus slimības bruņās, pētījumu organizēja Vēža pētījumu institūts Londonā, Lielbritānijā.
Prostatas vēža izaicinājumi
Prostatas vēzis ir otrais izplatītākais vēzis vīriešu vidū Amerikas Savienotajās Valstīs. Šogad ASV būs aptuveni 164 690 jauni prostatas vēža gadījumi un gandrīz 30 000 šīs slimības nāves gadījumu.
Lai gan pētnieki ir guvuši panākumus prostatas vēža izpratnē un ārstēšanā, joprojām pastāv vairākas grūtības.
Kā skaidro pētījuma vadītājs prof. Rosalinds Eelss: "Viens no izaicinājumiem, ar kuriem mēs saskaramies vēža izpētē, ir slimības sarežģītība un milzīgais skaits veidu, kā mēs to varētu potenciāli ārstēt."
Dr. Justīne Alforda no Lielbritānijas Vēža pētījumiem izklāsta vēl vienu problēmu, pētot un iejaucoties prostatas vēža ārstēšanā.
"Galvenais šķērslis turpmāka progresa panākšanai pret prostatas vēzi," viņa paskaidro, "ir tas, ka trūkst veidu, kā precīzi paredzēt, kā cilvēka slimība progresēs, tāpēc ir grūti noteikt, kura ārstēšana ir vislabākā katram pacientam."
Ģenētisko datu ievākšana
Lai tuvotos problēmai no jauna virziena, pētnieki ņēma ģenētisko informāciju no 112 vīriešiem ar prostatas vēzi un apvienoja to ar vairāku citu pētījumu datiem. Kopumā tika izmantoti 930 pacientu paraugi.
Izmantojot jaunākās lielo datu metodes, komanda ieguva jaunu ieskatu par ģenētiskām izmaiņām, kas izraisa prostatas vēža attīstību un veicina tā progresu. Kad viņi saprata, kuri gēni ir iesaistīti, viņi varēja izveidot olbaltumvielu karti, ko kodē šie gēni.
Pēc tam viņi pievērsās datubāzei ar nosaukumu canSAR, kas apvieno pētījumu datus, izmanto mašīnmācīšanos un palīdz sniegt ieskatu zāļu atklāšanā.
Savā vietnē canSAR izskaidro jautājumus, uz kuriem viņu datu bāzes mērķis ir atbildēt: “Kas ir zināms par olbaltumvielām, kādos vēžos tas tiek izteikts vai mutēts, un kādus ķīmiskos rīkus un šūnu līniju modeļus var izmantot, lai eksperimentāli pārbaudītu tā darbību? Kas ir zināms par zālēm, tās šūnu jutīguma profilu un ar kādām olbaltumvielām saistās, kas var izskaidrot neparastu bioaktivitāti? "
Zinātnieki atklāja, ka 80 no olbaltumvielām, kuras viņi bija atklājuši, bija potenciālie narkotiku mērķi. Un 11 no tām bija mērķētas ar esošajām zālēm, un uz septiņām citām zālēm varēja mērķēt jau klīniskajos pētījumos.
Viņu atklājumi šonedēļ tiek publicēti žurnālā Dabas ģenētika.
"Mūsu pētījumā lielo datu analīzē tika izmantotas mūsdienīgas metodes, lai iegūtu daudz jaunas informācijas par prostatas vēzi un iespējamiem veidiem, kā apkarot šo slimību."
Prof. Rosalind Eeles
Skatoties nākotnē
Atklājumi, protams, prasīs papildu izpēti, pirms tos varēs klīniski izmantot, taču tie sniedz virkni jaunu iespēju.
Kā paskaidro līdzautors prof. Pauls Workmans: “Šis pētījums ir atklājis ārkārtīgi lielu skaitu jaunu gēnu, kas veicina prostatas vēža attīstību, un sniedzis mums svarīgu informāciju par to, kā izmantot slimības bioloģiju, lai atrastu potenciālu jaunu ārstēšanu. ”
Viņš cer, ka viņu darbs "stimulēs jaunu pētījumu vilni par ģenētiskajām izmaiņām un potenciālajiem narkotiku mērķiem, kurus viņi ir identificējuši, ar mērķi pacientiem gūt labumu pēc iespējas ātrāk".
Vēl viens klupšanas akmens prostatas vēža ārstēšanas plānošanā ir veids, kā slimība katram cilvēkam progresē atšķirīgi. Tas padara daudz grūtāku izlemt, kuras ārstēšanas iespējas ir vispiemērotākās katram pacientam.
Dr Alford cer, ka “[vēlreiz] ievērojami uzlabojot mūsu izpratni par slimības ģenētiku, […] nākotnē šīs zināšanas varētu palīdzēt ārstiem labāk pielāgot ārstēšanu indivīda vēzim un, cerams, redzēt vairāk cilvēku, kas izdzīvo no savas slimības. ”
Šīs ir agrīnas dienas, taču secinājumi, kas iegūti no nākamās paaudzes pētījumiem, varētu pārveidot šo jomu.
